KAGIANA

English version is here

2008年11月12日新規開設、2009年7月29日更新

ここはシロイヌナズナ共発現遺伝子の機能情報を検索する KAGIANAツールのサイトです。

TAIR9に対応しました！

Gene Ontologyのデータを修正しました！

共発現遺伝子解析データベース CoP （旧CoexProcess）と相互リンクしています。

注意！「Data」シートを今回の更新に伴って再構成しています。
「Selected_DB_Link」シートのリンク先を修正・追加しています。

ダウンロード

• KAGIANA英語版・マクロプログラムなし (KAGIANA0906e.xls)　公開中！



• KAGIANA英語版・マクロプログラム付き (KAGIANA0906m.xls), 近日公開予定



• KAGIANA日本語版・マクロプログラムなし (KAGIANA0906j.xls)　公開中！

ZIPファイルを解凍するパスワードは「nedo」です。
マッキントッシュユーザーの場合、パスワード付きのZIPファイルを解凍するために、 StuffIt Expander のような解凍ツールを使うことをお勧めします。
Excel 2007以降のユーザーの場合、マクロプログラムを利用するためには、 KAGIANAツールを信頼されるフォルダ内に保存してお使いになることをお勧めします。

マクロプログラムの概要

現在調整中です。

古いバージョンのKAGIANAは こちら から入手できます。

遺伝子間発現相関データファイル （ATTED-IIデータベースから取得）

• 相関係数0.4以上 (54.7MB)
• 相関係数0.5以上 (21.7MB)
• 相関係数0.6以上 (8.5MB)
• 相関係数0.7以上

ZIPファイルを解凍する際のパスワードは「nedo」です。

これらの相関データは ATTED-II 管理者の大林博士のご厚意により、掲載しています。

出版物

• Bioinformatics tools to discover co-expressed genes in plants. Ogata, Y., Sakurai, N., Provart, N.J., Steinhauser, D., Krall, L. In The handbook of Plant Functional Genomics Concepts and Protocols, edited by Kahl, G. and Meksem, K. pp. 309-335, WILEY-VCH Verlag. GmbH & Co. KGaA, Weinheim (2008)



• KAGIANA: an Excel-based tool for retrieving summary information on Arabidopsis genes. Ogata, Y., Sakurai, N., Aoki, K., Suzuki, H., Okazaki, K., Saito, K., Shibata, D. Plant and Cell Physiology, 50(1):173-177 (2009)

リンク

植物共発現データベース